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Anzahl der Publikationen: 7
Zeitschriftenartikel
Zacher, Benedikt; Michel, Margaux; Schwalb, Björn; Cramer, Patrick; Tresch, Achim und Gagneur, Julien
(2017):
Accurate Promoter and Enhancer Identification in 127 ENCODE and Roadmap Epigenomics Cell Types and Tissues by GenoSTAN.
In: PLOS One 12(1), e0169249 [PDF, 6MB]
In: PLOS One 12(1), e0169249 [PDF, 6MB]
Michel, Margaux; Demel, Carina; Zacher, Benedikt; Schwalb, Björn; Krebs, Stefan; Blum, Helmut; Gagneur, Julien und Cramer, Patrick
(2017):
TT-seq captures enhancer landscapes immediately after T-cell stimulation.
In: Molecular Systems Biology, Bd. 13, Nr. 3, 920
Glas, Julia; Dümcke, Sebastian; Zacher, Benedikt; Poron, Don; Gagneur, Julien und Tresch, Achim
(2016):
Simultaneous characterization of sense and antisense genomic processes by the double-stranded hidden Markov model.
In: Nucleic Acids Research, Bd. 44, Nr. 5, e44
[PDF, 3MB]
Schwalb, Björn; Michel, Margaux; Zacher, Benedikt; Frühauf, Katja; Demel, Carina; Tresch, Achim; Gagneur, Julien und Cramer, Patrick
(2016):
TT-seq maps the human transient transcriptome.
In: Science, Bd. 352, Nr. 6290: S. 1225-1228
Zacher, Benedikt; Lidschreiber, Michael; Cramer, Patrick; Gagneur, Julien und Tresch, Achim
(2014):
Annotation of genomics data using bidirectional hidden Markov models unveils variations in Pol II transcription cycle.
In: Molecular Systems Biology, Bd. 10, Nr. 12, 768
[PDF, 2MB]
Schmidt, Christine S.; Bultmann, Sebastian; Meilinger, Daniela; Zacher, Benedikt; Tresch, Achim; Maier, Kerstin C.; Peter, Christian; Martin, Dietmar E.; Leonhardt, Heinrich und Spada, Fabio
(2012):
Global DNA hypomethylation prevents consolidation of differentiation programs and allows reversion to the embryonic stem cell state.
In: PLOS ONE 7(12), e52629 [PDF, 1MB]
In: PLOS ONE 7(12), e52629 [PDF, 1MB]
Zacher, Benedikt; Kuan, Pei Fen und Tresch, Achim
(2010):
Starr: Simple Tiling ARRay analysis of Affymetrix ChIP-chip data.
In: BMC Bioinformatics
11:194
[PDF, 1MB]